روابط مصر و عربستان به علت اختلاف‌نظرهای دوطرف درباره برخی مسائل منطقه‌ای روز‌به‌روز تیره‌تر می‌شود. نظام کنونی مصر که با کنار زدن اخوان‌المسلمین خود را به قدرت رساند، از این گروه و به قدرت رسیدن آن چه در مصر و حتی در کشورهای دیگر چون سوریه و لیبی یا یمن هراس دارد و به قدرت رسیدن اخوان‌المسلمین را خطری علیه ثبات منطقه و در نتیجه خطری علیه خود به شمار می‌آورد. اما در مقابل عربستانی‌ها با وجود علم به این نگرانی‌های طرف مصری، از اخوان‌المسلمین حمایت می‌کنند و اخیرا دیدارهایی با برخی اعضای آن انجام داده‌اند. طبق این گزارش، محمد بن نایف، ولیعهد سعودی در جریان سفر اخیر خود به آنکارا یعنی 29 سپتامبر 2016، با مسؤولان ارشد اخوان‌المسلمین مصر دیدار کرده است؛ مسؤولانی که متواری و تحت تعقیب دستگاه قضایی مصر هستند. به نوشته روزنامه الوطن مصر، پس از فاش شدن سندی درباره دیدار محمد بن‌نایف با مسؤولان ارشد اخوان‌المسلمین مصر در پایتخت ترکیه، دفتر عبدالفتاح السیسی، رئیس‌جمهوری مصر خواستار اخراج احمد عبدالعزیز قطان، سفیر عربستان از قاهره شده است. در این سند آمده که نایف به مسؤولان اخوان‌المسلمین وعده داده است در سالگرد انقلاب 25 ژانویه مصر کمک‌هایی را به آنها برساند که همین امر باعث عصبانیت مقام‌های مصری شده است. سفیر عربستان در قاهره هم برای توضیح علت دیدار بن‌نایف با مسؤولان ارشد اخوان‌المسلمین، به وزارت خارجه مصر احضار شد. همچنین در سندِ فاش شده آمده است: بن‌نایف در دیدار با مسؤولان اخوان گفته بود ملک سلمان بن‌عبدالعزیز، پادشاه سعودی وی را مکلف به کمک کردن به اخوان‌المسلمین در ششمین سالگرد انقلاب 25 ژانویه کرده است.
شکایت عربستان از مصر به سازمان ملل
در پی رای دادگاه عالی مصر درباره بطلان توافق واگذاری 2 جزیره تیران و صنافیر به عربستان، رئیس مرکز مطالعات راهبردی عربستان در گفت‌وگو با شبکه خبری بی‌بی‌سی گفت: از جمله سناریوهای پیش‌روی عربستان سعودی درباره لغو توافق واگذاری تیران و صنافیر به این کشور، رجوع به داوری بین‌المللی و سازمان ملل است. انور ماجد گفت: تنش در مناسبات عربستان و مصر تنها به موضوع این دو جزیره باز نمی‌گردد، بلکه این تنش‌ها ناشی از اختلافات 2 کشور درباره مسائل منطقه‌ای است.