ناهماهنگی بین بعضی دستگاه‌ها از جمله مجادله گمرک و وزارت صنعت بر سر سامانه جامع تجارت باعث به وجود آمدن کاستی‌هایی در کنترل قاچاق کالا شده است. به گزارش تسنیم، در نشست مشترک ستاد مبارزه با قاچاق کالا و ارز و کمیسیون اقتصادی مجلس، سازمان بازرسی کل کشور در گزارشی اعلام کرد: با اینکه قانون مبارزه با قاچاق کالا و ارز مدت‌هاست ابلاغ شده اما ناهماهنگی بین بعضی دستگاه‌ها باعث به وجود آمدن کاستی‌هایی در کنترل قاچاق کالا شده است، برای مثال پتروشیمی یکی از استان‌ها با اینکه استفاده‌کننده‌های روستایی و صنعتی استان خود را به جای مصرف گازوئیل و نفت به مصرف گاز سوق داده است اما در کمال تعجب هنوز سهمیه نفت و گازوئیل آنها را قطع نکرده و ما در گزارش‌های خود متوجه قاچاق حجم عظیمی از این دو نوع سوخت از این استان به خارج از کشور شدیم.  نماینده سازمان بازرسی کل کشور افزود: همچنین آمارهای متعجب‌کننده‌ای مثل یک‌میلیارد دلار قاچاق طلا  به کشور نشان‌دهنده نیاز به هماهنگی بیشتر دستگاه‌های عضو ستاد مبارزه با قاچاق کالا و ارز است. وی تصریح کرد: یکی دیگر از مشکلات بزرگ ما، امن بودن مسیرهای قاچاق کالا برای قاچاقچیان و راه‌اندازی نشدن سامانه جامع تجارت است.