درحالی که همه تصور می‌کردند محمدعلی نجفی به عنوان وزیر پیشنهادی علوم به مجلس معرفی ‌شود اما حسن روحانی روز گذشته «محمود نیلی‌احمدآبادی» را به‌عنوان وزیر پیشنهادی علوم به مجلس معرفی کرد. نیلی احمد‌آبادی هم‌اکنون سرپرست دانشگاه تهران است. در نامه روحانی به علی لاریجانی آمده است: احتراما، در اجرای اصل ۱۳۳ قانون اساسی جمهوری اسلامی ایران، شرح حال و برنامه جناب آقای دکتر محمود نیلی‌احمدآبادی، برای اخذ رای اعتماد جهت وزارت علوم، تحقیقات و فناوری به مجلس شورای اسلامی معرفی می‌گردد. به گزارش «وطن امروز» این درحالی است که نجفی پیش‌تر ابراز تمایل کرده بود روحانی او را به‌عنوان وزیر پیشنهادی به مجلس معرفی کند. اظهارات محمدباقر نوبخت و تایید تلویحی معرفی نجفی نیز معرفی سرپرست وزارت علوم به‌عنوان وزیر پیشنهادی را تقویت می‌کرد. این ماجرا زمانی قطعی به نظر می‌رسید که نمایندگان کمیسیون آموزش مجلس خبر دادند محمدعلی نجفی 2 برنامه 3 و 7 ساله برای مدیریت وزارت علوم به اعضای این کمیسیون ارائه کرده است.