پس از علی شمخانی، دبیر شورایعالی امنیت ملی، محسن رضایی، دبیر مجمع تشخیص مصلحت نظام نیز گزارش آمانو درباره پی‌ام‌دی و ادعای او درباره تلاش ایران برای ساخت سلاح هسته‌ای در سال‌های 2002 تا 2003 را غیر قابل قبول دانست. محسن رضایی گفت: گزارش اخیر آمانو موذیانه بود و معلوم است آنها علیه ایران مقاصد خطرناکی دارند. به گزارش تسنیم، محسن رضایی، دبیر مجمع تشخیص مصلحت نظام با حضور در برنامه نگاه یک و در پاسخ به سوالی مبنی بر اینکه گزارش اخیر آمانو از نظر شما سیاه بود یا سفید؟ اظهار داشت: باید اسم پرونده پی‌ام‌دی را اتهامات هسته‌ای نامگذاری کرد. از گزارش آقای آمانو پیداست که آنها قبل از برجام به آن پرونده امید بسته بودند و گزارش آمانو موذیانه است و حکایت از حیوان درنده‌ای دارد که از طعمه‌اش ناامید شده است. وی ادامه داد: معلوم است که آنها علیه ایران مقاصد خطرناکی داشتند یعنی به دنبال این بودند که با این پرونده اقدامات بیشتری علیه ما انجام دهند. ما از این موضوع عبور کردیم و ادعاهای آقای آمانو در گزارش اخیر هیچ سندیتی نخواهد داشت و قابل استفاده علیه ما نخواهد بود. دبیر مجمع تشخیص مصلحت نظام در پاسخ به سوالی مبنی بر اینکه با توجه به اشاره گزارش آژانس مبنی بر تلاش ایران برای استفاده از سلاح هسته‌ای تا قبل از سال 2003 پاسخ شما به این ادعا چیست، گفت: ما اگر این کار را می‌کردیم، حق داشتیم؛ چرا که طرف مقابل ما صدام بود که به شیمیایی مجهز شده بود و به سمت سلاح‌های میکروبی و اتمی پیش می‌رفت. رضایی افزود: اگر ما به سمت سلاح هسته‌ای می‌رفتیم، حق داشتیم منتها ما در زمان جنگ روی این موضوع بحث کردیم که اگر صدام خواست با بمب اتم تهران را تهدید کند ما چه کاری انجام دهیم ولی با همه این وجود هیچ اقدامی نکردیم. چطور می‌شود بعد از آن شرایط ما به دنبال سلاح هسته‌ای رفته باشیم؟ رضایی در پاسخ به این پرسش که آیا پذیرش ادعای آژانس درباره تلاش ایران برای ساخت بمب اتم قبل از سال 2003 می‌تواند برای ما بار سیاسی و حقوقی داشته باشد، خاطرنشان کرد: بله، ما نباید مسیر حقوقی را در این زمینه رها کنیم. دولت ایران باید به این ادعا اعتراض کند و یادداشت رسمی حقوقی بدهد و در مجامع بین‌المللی ثبت شود. ما نباید صرف اینکه زبانی چیزی گفته شود، اکتفا کنیم. وی تأکید کرد: ما به هیچ وجه نباید زیر بار گزارش آمانو درباره پرونده هسته‌ای ایران برویم.