مراجع عظام تقلید در پی درگذشت مرحوم آیت‌الله عباس واعظ‌طبسی، پیام تسلیت صادر کردند. آیت‌الله‌العظمی نوری‌همدانی در پیام تسلیت خود به مناسبت درگذشت آیت‌الله واعظ‌طبسی نوشت: «این شخصیت عالیقدر با حضور شجاعانه در دوران مبارزه با رژیم ستم‌شاهی هدایت مردم خراسان را عهده‌دار بود و بعد از پیروزی انقلاب، یکی از چهره‌های تاثیرگذار بود که در نظام اسلامی نقش‌آفرینی کرده است و سالیان متمادی توفیق و افتخار خدمتگزاری در آستان مقدس امام هشتم حضرت علی بن موسی‌الرضا علیه آلاف التحیه و السلام را به عهده داشت و توانست با مدیریت عالی و با اخلاص کامل، خدمات شایسته‌ای انجام داده و آن مرکز قدسی را به عنوان پایتخت معنوی جهان اسلام معرفی نماید که از الطاف آن حضرت بهره‌مند خواهد شد». در پیام تسلیت آیت‌الله‌العظمی مکارم‌شیرازی نیز آمده است: «این عالم ربانى علاوه بر نقش بسیار مؤثرى که در به ثمر رسیدن انقلاب اسلامى داشت در آستان قدس رضوى تحول بى‌سابقه‌اى ایجاد کرد و چندین برابر آنچه بود بر آن آستان مقدس افزود تا زائران آن آستان مقدس در رفاه کامل باشند. مدارس علمیه متعدد، کتابخانه پرشکوه و حسینیه‌هاى باشکوه تأسیس کرد، افزون بر اینها با استفاده از عمر پربرکتش نهاد فرهنگى گسترده و فعالى براى آستان قدس رضوى فراهم ساخت تا زائران این بقعه مقدسه دست خالى برنگردند و با آگاهى بیشتر از اصول و فروع اسلام به دیار خود بازگردند. به یقین مى‌توان گفت آستان قدس از روز اول تا زمان او تولیتى همانند او نداشته است». آیت‌الله‌العظمی جوادی‌آملی نیز در پیام تسلیت خود به مناسبت درگذشت آیت‌الله واعظ‌طبسی نوشت: «اکنون که جامعه ولایتمدار ایران داغدار شهادت صدیقه‌کبری سلام‌الله‌علیها است که خطبه بی‌بدیل آن بانو بر اثر محتوای قرآنی خود جاودانه خواهد بود به ماتم دردناکی آزمون شده است، ضمن درخواست استحکام نظام اسلامی، صبر جمیل برای همگان بویژه مسؤولان محترم آستان قدس و بیت معظم آن فقیه راحل مسألت می‌شود».