بانک مرکزی منابع موجود برای مسکن‌مهر را در حالی که بیش از یک میلیون خانوار چشم‌انتظار بوده‌ و در صورت توقف این طرح زیان‌های اقتصادی و اجتماعی بسیاری را می‌دیدند، به سمت شبکه بانکی منحرف کرده تا نامحرم‌ترین بخش به این منابع خود مسکن‌مهر باشد. سال 93، یکی از سخت‌ترین سال‌های مسکن‌مهر بود، به گونه‌ای که طبق گزارش مجلس شورای اسلامی کاهش 86درصدی تسهیلات مسکن، زمینه توقف این طرح و بلاتکلیفی نزدیک به یک میلیون خانوار را فراهم کرد. به گزارش نسیم‌آنلاین، توقف مسکن‌مهر همچنین سبب افزایش قیمت مسکن‌مهر در سال‌های آتی شد که فشار مضاعفی را بر دوش متقاضیان گذاشت. کاهش تخصیص تسهیلات به مسکن در حالی اتفاق افتاد که طبق برآوردها و محاسبات انجام شده توسط کمیسیون عمران مجلس، بیش از 7 هزار میلیارد تومان منابع در اختیار بانک مسکن برای تخصیص به این طرح بوده است که این تسهیلات می‌توانست بخش عمده‌ای از مسکن‌مهر را به اتمام برساند. سوالی که همیشه در مقابل کارشناسان قرار داشت این بود که بانک مسکن منابع در اختیار خود برای مسکن‌مهر را چه کرده است؟ این در حالی است که گزارش حسابرسی شده صورت مالی بانک مسکن در سال 93 نشان می‌دهد این بانک بیش از 8 هزار میلیارد تومان تسهیلات بین بانکی در اختیار بانک‌های دیگر گذاشته است، در حالی که اعطای تسهیلات بین بانکی در بانک مسکن در سال‌های گذشته صفر بوده است. انتشار این مساله سبب شد کارشناسان انتقاداتی نسبت به بانک مسکن داشته باشند و عنوان کنند این کار بانک مسکن یک کار تجاری بوده است و بر خلاف اهداف بانک مسکن به عنوان یک بانک توسعه‌ای است و در حیطه وظایف این بانک نمی‌گنجد. این انتقاد سبب شد رحیمی انارکی، عضو هیات مدیره بانک مسکن در جواب این انتقاد عنوان کند بانک مسکن براساس تکلیف بانک مرکزی اقدام به ارائه تسهیلات به دیگر بانک‌ها کرده است. این مساله بدان معناست که بانک مرکزی منابع موجود برای مسکن‌مهر را در حالی که بیش از یک میلیون خانوار چشم انتظار بوده‌اند و در صورت توقف این طرح زیان‌های اقتصادی و اجتماعی بسیاری را می‌دیدند، به سمت شبکه بانکی منحرف کرده است تا نامحرم‌ترین بخش به این منابع خود مسکن‌مهر باشد. حالا بعد از گذشت بیش از 3 سال از روی کار آمدن دولت، کم‌کم مشخص می‌شود علت عقب افتادن طرح مسکن‌مهر چه بوده و این طرح قربانی چه مسائلی شده است. دولت یازدهم از ابتدای روی کار آمدن به‌رغم ادعای دولتمردان هیچ تعهدی در قبال تکمیل طرح مسکن مهر از خود نشان نداد و کار به جایی رسید که دولتمردان بارها نسبت به این طرح هجمه وارد کردند.