فدراسیون بین‌المللی فوتبال، در احکامی که به دلیل اتفاقات رخ داده در بازی ایران و قطر صادر کرده است، جواد نکونام را به محرومیت 6 جلسه‌ای تعلیقی محکوم کرده است. براساس گزارش سایت فیفا، ایران روز اول سپتامبر یا ۱۱ شهریور و ۱۱ اکتبر یا۲۰ مهر میزبان تیم‌های ملی قطر و کره جنوبی بوده است. آن‌طور که سایت فیفا اشاره کرده است، براساس گزارش ناظر بازی، در بازی مقابل قطر از سوی تماشاگران بدرفتاری و توهین به قطری‌ها رخ داده و افراد غیررسمی در زمین بازی بسیار مشاهده شده‌اند. همچنین بدرفتاری تیم‌ملی فوتبال ایران با قطری‌ها هم باعث شده تا فیفا، فدراسیون فوتبال ایران را ۴۰ هزار فرانک سوییس (برابر با ۴۱۰۰۰ دلار) جریمه کند و البته از سوی فیفا اخطار رسمی دریافت کند. در بازی مقابل کره‌جنوبی، فیفا به دلیل برگزاری مراسم قبل از شروع بازی و بین 2 نیمه (مراسم مذهبی در روز تاسوعای حسینی)، استفاده از پهپاد در ورزشگاه و رفتار تماشاگران علیه کره‌ای‌ها، علاوه بر یک هشدار جدی به تیم‌ملی فوتبال ایران، فدراسیون فوتبال را ۴۵۰۰۰ فرانک سوییس برابر با ۴۶۰۰۰ دلار جریمه کرده است. کارلوس کی‌روش، سرمربی تیم‌ملی ایران به دلیل آنچه که احترام نگذاشتن به محوطه فنی در بازی مقابل قطر بوده اخطار گرفته است و همچنین به دلیل اظهاراتش پس از بازی با ازبکستان در کنفرانس مطبوعاتی، یک اخطار دیگر هم دریافت کرده است. برای جواد نکونام به دلیل رفتار غیرحرفه‌ای و تخلف در بازی مقابل قطر، ۶ جلسه محرومیت در نظر گرفته شده که 3 جلسه آن تعلیقی است اما در 3 بازی به طور قطع نمی‌تواند حضور داشته باشد. فیفا اعلام کرده در طول یک سال جواد نکونام زیر نظر خواهد بود و اگر این تخلف را تکرار کند، آن وقت از 3 بازی دیگر هم محروم خواهد شد.جواد نکونام ۲۵۰۰۰ فرانک سوییس یا ۲۶۰۰۰ دلار هم جریمه شده است.  فیفا سردار آزمون و احسان حاج‌صفی  را به دلیل رفتار غیرحرفه‌ای در بازی مقابل قطر به ترتیب یک و 2 بازی (یک بازی قطعی و یک بازی تعلیقی) محروم کرده است و هر کدام باید ۵۰۰۰ فرانک (۶۰۰۰ دلار) جریمه بپردازند. در همین حال، فدراسیون فوتبال قطر و 4 بازیکن این تیم را هم جریمه کرده است. فیفا فدراسیون فوتبال قطر را به دلیل بی‌انضباطی تیم‌ملی این کشور در بازی مقابل ایران در تهران، به پرداخت ۳۰۰۰۰ فرانک سوییس(۳۱ هزار دلار) محکوم کرده و البته 4 بازیکن این تیم به نام‌های حسن عبدالکریم، یاسر عبدالرحمان، عبدالله مشعل و خالد مفتاح را به ترتیب به پرداخت ۱۵ هزار فرانک سوییس و 3 جلسه محرومیت و 3 بازیکن دیگر را به پرداخت۷۵۰۰ فرانک سوییس و 2 بازی محرومیت، محکوم کرده است.