هیات دولت نیز در بیانیه‌ای درگذشت آیت‌الله هاشمی رفسنجانی را تسلیت گفت.
در بیانیه هیات دولت آمده است: عالم مجاهد، انقلابی نستوه و یار دیرین حضرت امام رضوان‌الله تعالی علیه که عمر پر برکت خود را در شکل‌گیری انقلاب اسلامی، استقرار نظام جمهوری اسلامی و ایفای مسؤولیت‌های خطیر در اداره کشور و دفاع‌مقدس سپری کرد به دیدار معبود شتافت. نام، یاد و آموزه‌های آن یار سفر کرده همواره بر تارک ایران و انقلاب اسلامی در درخشش و الگوی وفاداران به آرمان‌های انقلاب اسلامی خواهد بود.
این بیانیه می‌افزاید: هیات دولت جمهوری اسلامی ایران این ضایعه بزرگ را به حضرت بقیه‌الله الاعظم ارواحنا فداه، مقام معظم رهبری حضرت آیت‌الله خامنه‌ای مد ظله‌العالی، علما و مراجع بزرگوار تقلید، خانواده گرامی ایشان و ملت شریف ایران تسلیت عرض می‌کند و به مناسبت تجلیل از این یار دیرین امام و رهبری 3 روز عزای عمومی و روز سه‌شنبه 21 دی‌ماه 1395 را تعطیل عمومی اعلام می‌کند و ملت قدرشناس ایران را به شرکت باشکوه و تاریخی در مراسم تشییع پیکر پاک ایشان دعوت می‌نماید.