هفته‌نامه 9 دی از شکایت ریاست‌جمهوری در موضوع پایان‌نامه دکترای حسن روحانی تبرئه شد. هفته‌نامه 9 دی طی 6 شماره در تاریخ 15 مهر 96 تا 4 آذر 96 گزارشی را با عنوان «گزارش یک سرقت علمی، بررسی علمی اسناد به دست آمده در موضوع دکترای حسن روحانی» که انعکاس گوشه‌ای از یافته‌های گروه بررسی اصالت رساله‌ دکترای آقای روحانی بود، منتشر کرد. این گزارش، حاصل تلاش جمعی از دانشجویان و دانش‌آموختگان برترین دانشگاه‌های داخل و خارج از کشور و خلاصه‌ای از صدها ساعت کار کارشناسی بود. به دنبال انتشار این گزارش، معاون حقوقی رئیس‌جمهور ضمن کذب دانستن مستندات 9 دی، این گزارش را مصداق افترا و نشر اکاذیب دانست و از دادگاه ویژه روحانیت خواستار مجازات مدیر مسؤول این هفته‌نامه شد.  با شکایت حسن روحانی، مدیر مسؤول هفته‌نامه 9 دی از سال 96 طی چند نوبت بازپرسی شد و در نهایت، دادگاه حمید رسایی بهمن‌ماه سال 97 برگزار شد. در این دادگاه که بیش از 3 ساعت به طول انجامید، مدیر مسؤول هفته‌نامه 9 دی طی لایحه 200 صفحه‌‌‌ای، با ارائه مستندات علمی و کار کارشناسی انجام شده توسط اساتید دانشگاه، به دفاع از مطالب منتشرشده درباره سرقت علمی و تقلب انجام شده در پایان‌نامه دکترای حسن روحانی پرداخت. در نهایت این دفاعیات، رأی تبرئه مدیر مسؤول 9 دی توسط هیأت منصفه و قاضی دادگاه را به دنبال داشت. با وجود اعتراض ریاست‌جمهوری به رأی صادره و درخواست تجدیدنظر، مستشاران شعبه اول دادگاه تجدیدنظر نیز در تاریخ 12 اردیبهشت‌ماه جاری رای بدوی را تایید کردند. با توجه به رای دادگاه و تبرئه هفته‌نامه 9دی در این پرونده، وقوع سرقت علمی در پایان‌نامه دکترا حسن روحانی قطعی شده است و اکنون از وزارت علوم، مجلس و نهادهای نظارتی انتظار می‌رود در این پرونده ورود کنند.