برادرزاده جان اف. کندی، رئیس‌جمهور ترور شده اسبق آمریکا گفت در دهه ۱۹۶۰ جاسوسان آمریکایی که در حملات به کوبا نقش داشتند، از انگیزه، ابزارها و فرصت لازم برای اجرای ترور سال ۱۹۶۳ عمویش برخوردار بودند و تحقیقاتی که بعدا درباره این ترور انجام شد، تلاشی از سوی مدیر اسبق سازمان اطلاعاتی مرکزی آمریکا (سیا)‌ برای سرپوش گذاشتن بر واقعیت این ترور بود.

به گزارش راشاتودی، رابرت اف. کندی، نامزد ریاست‌جمهوری رقابت مقدماتی حزب دموکرات و برادرزاده جان اف. کندی، رئیس‌جمهور ترور شده اسبق آمریکا در مصاحبه‌ای با تاکر کارلسون، خبرنگار مستقل آمریکایی گفت انگیزه اصلی ترور عمویش را باید نزد گروهی از ماموران سازمان سیا در شهر میامی یافت. نامزد ریاست‌جمهوری حزب دموکرات توضیح داد: «این گروه از ماموران بسیار از عمویم به خاطر نفرستادن پوشش هوایی برای مجریان حمله مشهور خلیج خوک‌ها عصبانی بودند و حتی بعد از بحران موشکی ۱۹۶۲ کوبا خشم آنها بیشتر نیز شد».

رابرت کندی جونیور اضافه کرد: بعد از آنکه جان اف. کندی با نیکیتا خروشچف، رهبر شوروی سابق توافقی برای رفع بحران هسته‌ای منعقد کرد، «تمام حملات دفتر ۶۶ به کوبا و دیگر گروه‌هایی که کوبا را آزار می‌دادند، متوقف کرد».

به گفته برادرزاده جان اف. کندی، یک گروه مافیایی کوبایی به دنبال تصاحب مجدد کازینوها و دیگر املاک در شهر هاوانا که بعد از انقلاب کمونیستی فیدل کاسترو ملی شدند، بودند و سازمان سیا با این گروه همکاری داشت.

رابرت اف. کندی اظهار کرد جان اف. کندی از طرف دیگر برنامه داشت شاخه جمع‌آوری اطلاعات در سازمان سیا را از واحد برنامه‌ریزی این سازمان تفکیک کند. او مدعی شد واحد برنامه‌ریزی در سازمان سیا «همان کسانی هستند که افراد را ترور، در انتخابات‌ها دخالت و دولت‌ها را سرنگون می‌کنند».

به نوشته پایگاه راشاتودی، جان اف. کندی قبل از آنکه بتواند چنین برنامه‌هایی را پیاده کند، ۲۲ نوامبر ۱۹۶۳ حین سفر به شهر دالاس ترور شد. کمیسیون مشهور به کمیسیون «وارن» که بعد از ترور رئیس‌جمهور اسبق آمریکا با هدف تحقیقات درباره این حادثه تشکیل شد، نتیجه گرفت «لی هاروی اوسوالد» که با شلیک به کندی او را ترور کرد «مرد مسلحی تنها» بوده است. خود اوسوالد نیز تا زمان محاکمه خود زنده نماند و توسط «جک روبی» مالک یک باشگاه شبانه به شکلی خودسرانه در داخل یک گاراژ پلیس کشته شد. به ادعای رابرت اف. کندی جونیور، کمیسیون وارن واقعا توسط «قاضی ارل وارن» رهبری نمی‌شد، بلکه «آلن دالز» مدیر پرسابقه سازمان سیا که نوامبر ۱۹۶۱ توسط جان اف. کندی اخراج شد، آن را اداره می‌کرد. او اضافه کرد اسناد و مدارک قاطعی درباره «دست داشتن سازمان سیا در قتل عموی من و سرپوش گذاشتن بر آن» وجود دارد. نامزد ریاست‌جمهوری حزب دموکرات همچنین آلن دالز را متهم به تماس‌های مخفیانه با سازمان سیا و جی. ادگار هوور، مدیر اسبق اف‌بی‌آی کرده و گفت: «آلن دالز تنها کسی است که در هر نشستی شرکت کرد، هر سند و مدرکی را بررسی کرد و سوال‌های پرسیده شده از شاهدان را ارائه کرد. او کل کمیسیون وارن را اداره می‌کرد و او باید مظنون اصلی واقع می‌شد. کل موضوع مثل یک تئاتر ژاپنی کابوکی، هماهنگ شده بود».

سازمان سیا سال ۱۹۶۷ به نیروهای «عملیات مرغ مقلد» در مطبوعات آمریکا، کسانی که به گفته رابرت اف. کندی متشکل از بالغ بر ۴۰۰ نویسنده و دبیر ارشد بودند، دستور داد هر گونه انتقاد از یافته‌های کمیسیون وارن را به عنوان «تئوری توطئه» رد کنند.

رابرت اف. کندی ادعا کرد همه اسناد و مدارک مربوط به ترور جان اف. کندی باید تا سال ۲۰۱۷ از طبقه‌بندی خارج می‌شد اما سازمان سیا همچنان حدود ۴۰۰۰ سند از آنها را محرمانه نگه داشته است، در حالی که تقریبا همه کسانی که در این پرونده دخیل بوده‌اند، مرده‌اند. او به کارلسون بیان کرد: «به شکلی منصفانه می‌توان فرض کرد آنها از افراد محافظت نمی‌کنند، بلکه آنها مشغول محافظت از منافع سازمانی بوده‌اند».

طبق گزارش رسمی دولت آمریکا، جان اف. کندی ۲۲ نوامبر سال ۱۹۶۳ میلادی هنگام بازدید از شهر دالاس تگزاس و در حالی ‌که در یک خودروی روباز نشسته بود، هدف سوءقصد قرار گرفت. کمیسیون تحقیقاتی دولت آمریکا موسوم به «وارن» که از سوی لیندون جانسون، رئیس‌جمهور وقت آمریکا در سال ۱۹۶۴ تشکیل شد اعلام کرد کندی به دست «لی هاروی اوسوالد» کهنه‌سرباز نیروی دریایی آمریکا کشته شده و بر اساس اعلام این کمیسیون تحقیقاتی، اوسوالد همدستی نداشته و به صورت فردی اقدام به ترور رئیس‌جمهور آمریکا کرده است. لی هاروی اوسوالد شهروند آمریکایی بود که مدت‌ها در اتحاد جماهیر شوروی زندگی کرده بود. او ۲ روز پس از بازداشت، در زیرزمین اداره پلیس شهر دالاس تگزاس توسط جک روبی به ضرب گلوله به قتل رسید. 

۳ سال پس از ترور کندی، دادستانی آمریکایی با نام جیم گاریسون در منطقه نیواورلئان تحقیقاتی را درباره ترور کندی آغاز کرد و این تحقیقات او را به این نتیجه رساند که گروهی از افراط‌گرایان راست با عناصر ضدکمونیست و ضدکاسترو در سازمان سیا با توطئه کشتن کندی مرتبط بوده‌اند. طی سال‌های بعد گزارش‌های زیادی منتشر شد مبنی بر اینکه کندی به این دلیل کشته شد که از جنگ سرد رویگردان بود و به دنبال خلع سلاح هسته‌ای، خروج از جنگ ویتنام و نزدیک شدن به فیدل کاسترو بود.