در این مقاله قصد داریم تا به تحلیل علل عدم موفقیت فان‌خال در بایرن و به بن‌بست رسیدن بایرن و فان‌خال با یکدیگر بپردازیم.
1- تیم فان‌خال از همان ابتدا نیز می‌لنگید
درخشش بایرن در فصل اول حضور فان‌خال و در رقابت‌های مختلف مانع از نمایان شدن ضعف فنی فان‌خال در بایرن شد. فان‌خال در آلمان رقیب چندان قدرتمندی برای خود نمی‌دید و مسلما رقیبان را با تعداد گل‌های بسیار زیاد از دم تیغ خود عبور می‌داد اما در لیگ قهرمانان اروپا از همان ابتدا با عدم‌نتیجه‌گیری در مرحله گروهی و صعود ناپلئونی در روز پایانی مسابقات واضح بود که یک جای کار فان‌خال بشدت می‌لنگد. هر چند فان‌خال در دور‌های بعدی در مقابل فیورنتینا و منچستر و لیون بازی خوبی را ارائه کرد و توانست با برد در بازی‌های رفت و شکست در بازی برگشت و به لطف قانون گل زده در خانه حریف یونایتد و فیورنتینا را حذف کند اما همچنان فان‌خال از همان نقطه‌ای که مشخص بود می‌لنگید.
2- ضعف دفاعی فان‌خال و عدم‌تمرکز روی برنامه دفاعی برای تیم
لوئیس فان‌خال با فروش لوسیو و اضافه شدن هولگر بداشتوبر 19 ساله و از طرفی هم داشتن فان بویتن پا به سن گذاشته و دمیکلیس و برونوی نه‌چندان مطمئن نه از مهره‌های دفاعی خوبی بهره می‌برد و نه برنامه دفاعی خاصی در تیم داشت و عملا و صرفا به فکر ارائه یک بازی تهاجمی بر این اساس بود که بیشتر از حریف گل بزند و بدین شکل حریف خود را از پیش‌رو بردارد.
همین عامل و همین تفکر در فصل دوم تا جایی گسترش یافت که عملا فان‌خال در بسیاری از بازی‌ها در دفاع خود از هافبک‌هایی مثل گوستاوو و تیموشوک استفاده می‌کرد و به جای دفاع کلاسیک به فکر بازیسازی و شروع حمله از خط دفاعی بود که عملا دفاع بایرن و هافبک دفاع تیم را به پاشنه‌آشیل تیم تبدیل کرده بود.
3- خستگی بیش از حد بازیکنان و مصدومیت آنها در فصل دوم مسابقات
بازیکنان بایرن پس از انجام حدود 60 بازی باشگاهی با تیم‌های ملی خود به جام‌جهانی سفر کردند و در آنجا هم اکثرا تا مراحل پایانی تورنمنت صعود کردند تا جایی که در مرحله نیمه‌نهایی جام‌جهانی بایرن بیشترین تعداد ملی‌پوش در بین 4 تیم صعود‌کننده هلند، برزیل، اسپانیا و آلمان را دارا بود.
این حضور متداول بازیکنان بایرن در مسابقات و فرصت کوتاه استراحت تا شروع فصل باشگاهی جدید موجب تحلیل قوای جسمانی بازیکنان بایرن شد که پیامد آن مصدومیت پیاپی و متوالی بازیکنان این تیم بود (در فصل دوم حضور فان‌خال تنها بایرنی که مصدوم نشد فیلیپ لام کاپیتان آلمانی‌ها بود).
از همان ابتدا آرین روبن ستاره همیشه مصدوم باواریایی‌ها نیم‌فصل اول را از دست داد و بعد از آن مصدومیت‌های ریز و درشت زیادی گریبانگیر بایرن شد تا جایی که کمتر بازی‌ای را دیدیم که بایرن با ترکیب کامل خود و بدون حد‌اقل 3 مصدوم به زمین مسابقه برود.
4- فروش بازیکنان بدون توجه به مصدومیت متعدد بازیکنان و کمبود مهره
فان‌خال بدون توجه به آمار بالای مصدومیت در پست‌های مختلف و کمبود مهره در پست‌های مختلف از همان ابتدا دست به فروش بازیکنان مختلفی از جمله لوسیو، تونی، دمیکلیس، فان بومل و... زد که در ادامه نیاز به همین مهره‌ها حس شد.