سکانداری 4 ساله جواد شمقدری روی صندلی مدیریت سینمایی وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی با فراز و نشیب‌های زیاد و بعضا عجیب و غریبی روبه‌رو بوده به‌شکلی که در این مدت ماهی را نمی‌توان یافت که حداقل در چند روز حواشی جای متن را نگرفته باشد. به گزارش ایسنا، اگرچه سیاست‌های دوره مدیریت سینمایی در دولت اخیر باعث شد توجه عامه مردم به سینما بیش از پیش جلب شود اما همین توجه گاهی باعث دردسر‌هایی هم شد. در حوزه‌های مختلف هم دوران مدیریت شمقدری بدون حاشیه نبود: پایین آوردن «گشت ارشاد» و «خصوصی» از روی پرده از جانب حوزه هنری دعوای این نهاد با سازمان سینمایی را به بالاترین حد خود در سال گذشته رساند. سازمان سینمایی، حوزه هنری را به جانبداری و پایگاه دادن به خانه‌‌سینمایی‌ها متهم می‌کرد و در نهایت بیش از 10 فیلم در سال 91 نتوانستند در سینماهای حوزه هنری اکران شوند. حوزه هنری نظر حاکمیتی وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی را نقض کرد و اظهارنظرهای متقابل جواد شمقدری و محسن مومنی‌شریف تبدیل به‌یک دوئل 2 نفره شد.
کمتر علاقه‌مندی به سینما وجود دارد که داستان آنچه بر خانه سینما گذشت را نداند. در تازه‌ترین اقدام، رئیس‌جمهور دستور حل و فصل فوری این مشکل را صادر کرده اما شمقدری و یارانش همچنان بر روال گذشته معتقدند کارها آنطور که آنها قانونی می‌دانند باید انجام شود.
پس از آنکه خانه سینما توسط وزارت ارشاد تعطیل اعلام شد، با کمک سازمان سینمایی صنف تهیه‌کنندگی جدیدی وارد میدان شد و برخی منتقدان هیات مدیره خانه سینما و برخی از آنهایی که گرایشی به طرف خاصی نداشتند را جذب کرد. چندی پس از تشکیل این اتحادیه جدید‌التاسیس از هم پاشید و حتی بخشی از تهیه‌کنندگانی که از ابتدا این صنف را با عنوان «اتحادیه- 2» خطاب می‌کردند، حاضر نشدند برای صدور پروانه ساخت در اتحادیه تهیه‌کنندگان تشکیل پرونده دهند.
در سی‌امین جشنواره فجر، چندین و چند فیلم با تم خیانت روی پرده رفت که حواشی زیادی را برای سینمای ایران به‌دنبال داشت. این فیلم‌ها در ایام جشنواره از سوی منتقدان و اصحاب رسانه مورد انتقاد قرار گرفت و پس از آن هم حوزه هنری وارد ماجرا شد.
به یقین باید تبدیل معاونت به سازمان سینمایی و همچنین تشکیل شورایعالی سینما را از مهم‌ترین اقدامات مثبت جواد شمقدری در دوران مدیریتش در وزارت ارشاد دانست اما طبق اظهارنظرهای اخیر سینماگران، وعده‌های این سازمان و شورا چندان عملی نشده، طوری که شمقدری هنوز در مصاحبه‌های مختلفش از تلاش برای تثبیت وضع این سازمان سخن می‌گوید. شورایعالی سینما هم وضعی تقریبا مشابه دارد.
در سال 91، بحث تولید فیلم «لاله» به عنوان یک اثر فاخر و با بودجه‌ای میلیاردی مطرح شد و حتی کار را به‌جایی رساند که وزیر ارشاد و رئیس سازمان سینمایی برای ادای توضیحات به کمیسیون فرهنگی مجلس شورای اسلامی احضار شدند. سازمان سینمایی همچنین از «استرداد»، «عقاب صحرا»، «فرزند چهارم»، «چ» و «برلین منفی هفت» هم به عنوان فیلم‌های فاخر دیگرش نام برد.
حواشی اکران با نمایش «من مادر هستم» شعله‌ور شد. صبح یکی از روز‌های پاییز 91، انصار حزب‌الله روبه‌روی وزارت ارشاد تجمع کردند. این تحصن با شعارهایی علیه وزیر و معاونانش ادامه یافت و تا جایی پیش رفت که آنها شمقدری و معاونانش را به بی‌غیرتی متهم کردند!