در برخی فروشگاه‌ها علاوه بر محاسبه قیمت کالا با ارزش افزوده، دوباره در فاکتور خرید نیز مالیات بر ارزش افزوده از خریدار دریافت می‌شود که این امر تخلف است. برخی فروشگاه‌ها این مالیات را دریافت می‌کنند و برخی نیز از آن صرف‌نظر کرده‌اند. اما آنچه مشخص است اینکه اگر قیمت کالا با ارزش افزوده مشخص شده است، فروشنده حق ندارد مبلغ دیگری را بابت مالیات و عوارض ارزش افزوده از مشتری دریافت کند که البته شاید بهتر بود قیمت اصلی کالا بدون مالیات بر ارزش افزوده تعیین و مشخص می‌شد تا مصرف‌کننده در تشخیص قیمت واقعی دچار اشتباه نشود و قیمت واقعی را بداند و پس از آن و در زمان خرید کالا مالیات بر ارزش افزوده به آن اضافه شود. رضا زرین‌گل، رئیس بازرسی ویژه سازمان حمایت مصرف‌کنندگان و تولیدکنندگان در این باره به ایسنا گفت: قیمت نهایی کالاها و رقمی که باید خریدار به فروشنده بپردازد نباید بالاتر از قیمتی باشد که روی کالاها نصب شده و اگر در فاکتوری رقم نهایی که مشتری می‌پردازد بالاتر از قیمت مصرف‌کننده باشد، تخلف است. وی اضافه کرد: هیچ کدام از فروشگاه‌های زنجیره‌ای تخلف نمی‌کنند و اگر کسی معتقد است اینگونه فروشگاه‌ها مالیات بر ارزش افزوده مضاعف دریافت می‌کنند می‌تواند اعلام کند تا موضوع را پیگیری کنیم. زرین‌گل گفت: قیمت درج شده روی محصولات، شامل سود عمده‌فروشی و خرده‌فروشی، هزینه حمل کالا و مالیات بر ارزش افزوده است و نباید رقمی بیش از این میزان از مصرف‌کننده دریافت شود. وی ادامه داد: سازمان امور مالیاتی، برخی فروشگاه‌ها را ملزم کرده 8 درصد مالیات بر ارزش افزوده را در فاکتور‌هایی که به مصرف‌کننده می‌دهند، عنوان کنند. این دسته از فروشگاه‌ها 8 درصد مالیات را از قیمت مصرف‌کننده کسر کرده و در انتهای فاکتور خرید مشتری آن را به رقم کلی خرید اضافه کرده و از مصرف‌کننده دریافت می‌کنند.