کمتر از یک هفته پس از اعتراف صریح معاون امور سینمایی به اختلاف اساسی با مدیران فعلی سینما و به رغم برخی شایعات درباره ارتباط این اختلاف نظرها با عدم پرداخت کامل بودجه سال گذشته خانه سینما، معاونت امور سینمایی وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی روزگذشته با انتشار توضیحاتی به این شایعات پاسخ گفت. روابط عمومی این معاونت درباره تاخیر پرداخت باقیمانده بودجه خانه سینما در یادداشتی توضیحاتی ارائه و تاکید کرد: اختلاف میان معاونت سینمایی و هیات مدیره خانه سینما دلیل توقف بودجه اصناف و خانه سینما نیست. در این متن آمده است: «پیرو اخبار منتشر شده در برخی روزنامه‌ها درباره عدم پرداخت بموقع و کامل بودجه خانه سینما جهت شفاف‌سازی موارد ذیل به اطلاع می‌رسد: در پی مصاحبه مطبوعاتی معاونت محترم سینمایی که در آنجا به وضوح اعلام شد اختلاف نظر میان معاونت سینمایی و مدیرعامل خانه سینما ارتباطی با عدم اجرای تعهدات تفاهمنامه سال گذشته ندارد. از آنجا که در سال 1388 نزدیک 30 درصد از بودجه معاونت سینمایی پرداخت نشده و این کاهش پرداخت بودجه، شامل مؤسسات زیرمجموعه این معاونت نیز می‌شود.» در پایان این یادداشت، معاونت سینمایی یادآور می‌شود: «بدین‌وسیله اعلام می‌شود در موعد مقرر و زمانی که سقف کامل بودجه معاونت پرداخت شود تتمه بودجۀ مؤسسات وابسته معاونت سینمایی و از جمله خانه سینما پرداخت خواهد شد و اختلاف میان معاونت سینمایی و هیات مدیره خانه سینما دلیل توقف بودجه اصناف و خانه سینما نیست.» ارائه این توضیحات در حالی است که جواد شمقدری نیز در نخستین نشست خبری خود با اهالی رسانه در سال 89 ضمن تصریح بر این نکته که «بین خانه سینما و معاونت سینمایی اختلاف رویکرد زیادی وجود دارد و تعامل با مجموعه‌ای که سر جنگ دارد خیلی مشکل است» تاکید کرده بود: «تاخیر تخصیص بودجه خانه سینما جدا از این اختلافات است. این تاخیر در اعطای بودجه مربوط به کمبود 30 درصدی بودجه معاونت سینمایی است و به محض رفع این مشکل، 20 درصد باقیمانده بودجه خانه سینما تحویل داده خواهد شد».