گروه سیاسی:
با وجود اینکه تعدادی از نمایندگان مجلس مطرح شدن بحث وقف دانشگاه آزاد را اقدامی برای فرار از اجرای اساسنامه جدید دانشگاه آزاد می‌دانند، نایب رئیس مجلس اصلاح اساسنامه این دانشگاه در شورایعالی انقلاب فرهنگی را افراطی و مغایر با فلسفه اصلی ایجاد این دانشگاه دانست. محمدرضا باهنر در جلسه ماهانه جامعه اسلامی مهندسین که شنبه‌شب برگزار شد، به این دلیل به مخالفت با اصلاح اساسنامه دانشگاه آزاد پرداخت که عقیده داشت طبق اساسنامه جدید، اداره دانشگاه آزاد به‌عهده دولت است. این عضو مجمع تشخیص مصلحت نظام همچنین به مسائل مطرح شده در صحن مجلس و اعتراض نمایندگان مجلس و دانشجویان به تصویب یک‌فوریت طرح وقف اموال دانشگاه آزاد اشاره کرد و با بیان نقل قولی که مسوولان دانشگاه آزاد از مقام معظم رهبری درمورد وقف این اموال می‌کنند، گفت: برخی اظهار نظرها از سوی مسؤولان درباره وقف دانشگاه آزاد مطرح می‌شود که باید گفت مسؤولان باید مشکلات را برطرف کنند تا کار به مقام معظم رهبری نکشد و البته در صورت لزوم باید از رهبر معظم انقلاب استفتا کرد.
با این حال دیگر همکاران باهنر در مجلس شورای اسلامی با چنین عقیده‌ای موافق نیستند و حسین فدایی نماینده عضو کمیسیون اصل 90 مجلس معتقد است مسؤولان دانشگاه آزاد با رفتن به سوی وقف که ظاهری زیبا دارد، قصد دارند از اجرای اساسنامه فرار کنند.
حسین فدایی در گفت‌وگو با فارس با اشاره به موضوع وقف دانشگاه آزاد با بیان اینکه اموال دانشگاه آزاد ماهیت واحدی ندارد، افزود: برخی اموال دولتی بوده ولی بعضی همانند زمین‌ها مربوط به عموم هستند، این موارد دارای ضوابط و مقرراتی بوده و بر اساس آن ضوابط، مثلا زمین‌ها واگذار می‌شوند. وی در عین حال به صحبت‌های نزدیک به نظر باهنر نیز اشاره و خاطر نشان کرد: اینکه برخی ادعا کرده‌اند که اساسنامه جدید دانشگاه آزاد خلاف شرع و قانون است تنها یک ادعاست چرا که در شورایعالی انقلاب فرهنگی هم مجتهد وجود دارد و هم حقوقدان، بنابراین اگر کسی مطلبی را مدنظر دارد می‌تواند در شورایعالی انقلاب فرهنگی حضور یافته و موضوع را بیان کند.
معاون پارلمانی رئیس‌جمهوری نیز با بیان اینکه عمل وقف درباره اموال شخصی و برای در امان ماندن از دستبرد دیگران صورت می‌گیرد، گفت: براساس یک تفاهم میان مجلس شورای اسلامی و شورایعالی انقلاب فرهنگی، در سال‌های گذشته هرگاه یکی از این 2 مرجع به بررسی مساله‌ای می‌پرداخته‌اند، دیگری به این موضوع وارد نمی‌شده است و از همین رو، برخی نمایندگان مجلس معتقدند موضوع اصلاح اساسنامه دانشگاه آزاد دیگر نباید در مجلس مطرح می‌شد. میرتاج‌الدینی با اشاره به حضور نماینده مقام معظم رهبری در دانشگاه‌ها در جلسات بررسی اساسنامه دانشگاه آزاد گفت: حجت‌الاسلام محمدیان در جلسات اصلاح اساسنامه دانشگاه آزاد که در شورایعالی انقلاب فرهنگی دنبال می‌شد حضور داشته و همچنین با حضور بعضی از علما در شورایعالی انقلاب فرهنگی، قطعا با رعایت همه ابعاد شرعی آن، تغییرات اساسنامه اعمال شده و به تصویب رسیده است.