تاخیر در عملیات پروازی از مشکلات همیشگی زائران است و مسؤولان شرکت‌های هواپیمایی می‌گویند که در این میان عوامل متعددی مانند قدیمی بودن هواپیما، هماهنگی ارگان‌ها و شرایط جوی نقش دارند. باوجود تمام تلاش‌ها در کاهش زمان تاخیر برای پرواز حجاج به مکه مکرمه و مدینه منوره، تقریباً 1000 زائر ایرانی به دلیل نقص فنی در هواپیما و شرایط جوی نامناسب حدود 6 تا 18 ساعت معطل شدند.
رئیس ستاد عمره مدینه با اشاره به تأخیر در 4 پرواز حجاج ایرانی به سمت عربستان گفت: پروازهای با تأخیر از استان‌های هرمزگان، اردبیل، آذربايجان شرقي و غربي بوده است. مسعود مجردی ادامه داد: پروازهای استان هرمزگان و اردبیل به دلیل بدی آب و هوا و پروازهای شهرهاي اروميه و تبريز به دلیل نقص فنی با تأخیر انجام شد. وی گفت: از آغاز موسم حج تاکنون حدود 700 پرواز از تهران به سمت عربستان انجام شده است. این تاخیر‌ها در حالی است که رئیس هیات‌مدیره و مدیر عامل هواپیمایی جمهوری اسلامی ایران (هما) چندی پیش و در آغاز اعزام حجاج گفته بود: در صدد هستیم میانگین تاخیر پروازهای زائران حج تمتع امسال را به 10 دقیقه برسانیم. سعید حسامی در ادامه افزوده بود: میانگین تاخیر پروازهای حج تمتع سال گذشته با توجه به تاخیر زیاد 2 پرواز حجاج که به خاطر بارش برف بوده، 9 دقیقه برآورد شد و امیدواریم امسال نیز به این عدد برسیم. وی با بیان اینکه از نظر فنی امکان ندارد عملیات گسترده‌ای مثل سفر حج بدون تاخیر صورت گیرد، افزود: سال گذشته حرکت بی‌نظیری درباره کاهش تاخیر پروازهای حجاج به بیت‌الله‌الحرام داشتیم که امیدواریم امسال نیز با برنامه‌ریزی‌های انجام شده به یک حرکت قابل توجهی در این زمینه دست یابیم. وی درباره احتمال تداخل پروازهای بین‌المللی و داخلی با پرواز حجاج بیت‌الله‌الحرام هم گفت: به هیچوجه در پروازهای داخلی ما تغییری ایجاد نخواهد شد و تداخلی در پرواز حجاج ایرانی با پروازهای داخلی و خارجی وجود ندارد.
حسامی افزود: با برنامه‌ریزی‌های صورت گرفته تاخیر در عملیات رفت بسیار پایین خواهد بود تا به میانگین 10 دقیقه برسیم اما زمان برگشت حجاج تابع پروازهای فرودگاه جده و مدینه است. امسال 104هزار ایرانی به مکه معظمه و مدینه منوره اعزام می‌شوند و عملیات برگشت زائران نیز از 23 آذر آغاز و تا 11دی ادامه خواهد داشت. هر یک از کاروان‌های زائران یک پزشک دارد و این پزشکان علاوه بر معاینات و کارهای مقدماتی که در ایران انجام می‌دهند، همراه کاروان‌ها در زمان رفت و برگشت در این سفر معنوی هستند و اگر بیماری نیاز به برگشت به کشور را پیدا کند، هیات پزشکی اقدامات لازم را در این زمینه انجام می‌دهند.