چندین هفته قبل از شهادت آیت‌الله صدوقی، جوانی حدودا 25 ساله در مسجد ایشان پیدا شده بود و زاهدانه به مسجد رفت و آمد می‌کرد. این برخورد او باعث می‌شد کسی به او بدبین نشود. روز 11 تیر سال 60 مصادف با دهم ماه مبارک رمضان که با روز جمعه همزمان شد، آیت‌الله صدوقی غسل جمعه کرد و به طرف مسجد «ملااسماعیل» حرکت کرد. خطبه‌های نماز جمعه را خواند و سپس به نماز ایستاد و چون نماز تمام شد آن جوان که بعدها معلوم شد از وابسته‌های منافقين است از پشت‌سر به آقا هجوم آورد. ناگاه صدای انفجار مهیبی در فضای مسجد پیچید و شور و غوغای عجیبی همه مسجد را فرا گرفت... .