حضرت آیت‌الله خامنه‌ای رهبر معظم انقلاب اسلامی در پیامی، رحلت عالم مجاهد آیت‌الله آقای حاج سیدمحمدحسین فضل‌اللهرحمه ًْ الله‌علیه را تسلیت گفتند.
متن این پیام به این شرح است:
بسم‌الله الرحمن الرحیم
رحلت عالم مجاهد آیت‌الله آقای حاج سیدمحمدحسین فضل‌الله رحمه ًْالله‌علیه را به بیت شریف فضل‌الله و همه ارادتمندان و دوستداران آن مرحوم در لبنان و جوامع لبنانی‌تبار در آفریقا و آمریكای لاتین و به عموم شیعیان لبنان تسلیت می‌گویم. این عالم بزرگوار و سختكوش، در عرصه دین و سیاست، شخصیتی اثرگذار بود و لبنان تا سال‌های طولانی، خدمات و بركات او را از یاد نخواهد برد. مقاومت اسلامی لبنان كه دارای حق عظیمی بر امت اسلامی است در همه عمر با بركت خود، مشمول حمایت و همكاری و كمك این روحانی مجاهد بود، ایشان همچنین برای جمهوری اسلامی یاوری با اخلاص و صمیمی به شمار می‌رفت و در همه دوران 30 ساله همواره در زبان و عمل، وفاداری خود را به انقلاب اسلامی و نظام جمهوری اسلامی به اثبات رسانید. از خداوند متعال مسألت می‌كنم كه رحمت و مغفرت خود را بر روح این سید شریف و عزیز نازل فرماید و او را با اجداد طاهرینش محشور نماید.
سید علی خامنه‌ای
14/تیر/1389