اینیستا با وجود مصدومیتش، در لیست 23 نفره دل بوسکه جای داشت و با شروع اردوی ماتادورها برای رقابت‌های جام‌جهانی، اینیستا همچنان مصدوم بود. او ابتدای این رقابت‌ها را با مصدومیت دنبال می‌کرد ولی در نهایت با اطاعت از دستورات پزشک تیم، توانست به ترکیب اسپانیا بازگردد و به لافوریا روخا در افتخارآفرینی کمک شایانی برساند. از دیدار مقابل شیلی تا فینال، اینیستا همواره یکی از قابل اعتمادترین مهره‌های دل بوسکه بود و جانی هیتینگا به دلیل خطایی که روی اینیستا در دیدار فینال مرتکب شد، با کارت قرمز داور مواجه و زمین مسابقه را ترک کرد. در نهایت هم گل دقیقه 116 بازی که گل قهرمانی اسپانیا بود، توسط اینیستا وارد دروازه هلند شد.