حضرت آيت‌الله‌العظمي خامنه‌اي رهبر انقلاب اسلامي و فرمانده‌كل‌قوا در حكمي اميرسرتيپ فرزاد اسماعيلي را به سمت فرماندهي قرارگاه پدافند هوايي خاتم‌الانبياء صلي‌الله‌عليه‌و‌آله‌و‌سلم منصوب كردند. متن حكم حضرت آيت‌الله العظمي خامنه‌اي به اين شرح است:
بسم الله الرحمن الرحيم
امير سرتيپ فرزاد اسماعيلي
به پيشنهاد فرمانده كل ارتش جمهوري اسلامي ايران و نظر به تعهد و شايستگي، شما را به فرماندهي قرارگاه پدافند هوايي خاتم‌الانبياء صلي‌الله‌عليه‌و‌آله‌و‌سلم منصوب مي‌كنم.
ارتقاء آمادگي مورد نياز و تحقق اهداف پيش‌گفته را انتظار دارم.
از تلاش‌هاي ارزشمند اميرسرتيپ ميقاني در مدت تصدي اين مسؤوليت تشكر مي‌كنم.
توفيق همگان را از خداوند متعال مسالت دارم.
سيدعلي خامنه‌اي
3بهمن 1389