پس از انتشار گزارش كميسيون اصل ۹۰درباره ابعاد فتنه ۸۸، برادر محمد خاتمي تصميم گرفت به نيابت از وي به هجمه عليه اين گزارش بپردازد. به گزارش جوان‌آنلاين، محمدرضا خاتمي، دبيركل سابق حزب منحله مشاركت در يادداشتي كه سايت جرس منتشر کرد ضمن حمله به گزارش كميسيون اصل ۹۰ از موضعي طلبكارانه نشان داد براندازان و كودتاگران انتخابات ۸۸ چگونه از رأفت نظام اسلامي سوءاستفاده مي‌كنند. وي در بخش ديگري از يادداشت خود به دفاع از برادر خود كه نقش عمده‌اي را در ايجاد فتنه ۸۸ داشت، پرداخته و ضمن تایيد سفرهاي خارجي برادر خود براي انحراف اذهان مدعي شده كه اين سفرها با هماهنگي بوده است. محمدرضا خاتمی توضيح نداده كه آيا ديدار با جورج سوروس نيز با هماهنگي بوده است يا خير؟
وي در ادامه همچنين توضيح نداد كه افتتاح دفتر گفت‌وگوي تمدن‌ها در ژنو و ارتباط با داووس و شخصي به نام شواد، رئيس برگزاري داووس به چه دلايلي بوده است؟ دبيركل حزب منحله مشاركت در ادامه با انتقاد از اعضاي فراكسيون اقليت و ضمن گلايه از حضور آنان در انتخابات آتي مجلس، خطاب به آنان گفته است كه اگر واقعا اصلاح‌طلب هستند عليه گزارش كميسيون اصل ۹۰ نطق کنند!