روز 19 فوریه 2002، ژوزه مورینیو اولین بازی ليگ قهرمانان خود را براي پورتو انجام داد، آن هم در حالی که تازه نخستین ماه مربیگری خود را در این تیم سپری می‌کرد. مورینیو نخستین بازی ليگ قهرمانانی خود را در یکی از بهترین استادیوم‌های ممکن انجام داد: برنابئو. جنگنده، ژولیده، با لباس رسمی پورتو و حضور ویتور بایا در کنارش. این نخستین حضورش در کنفرانس مطبوعاتی بود و از همان زمان نشان داد که در حاضر جوابی و کنایه زدن دستی دارد: «ما توان اقتصادی رئال‌مادرید را نداریم که 2 توپ طلایی پیاپی (زیدان و فیگو) را به خدمت گرفته است. در برنابئو، تیم‌های بزرگی نظیر بارسا هم می‌ترسند اما تیم‌های کوچک چندان تحت تاثیر قرار نمی‌گیرند». پورتو در آن بازی با نتیجه یک بر صفر باخت هر چند در طول 90 دقیقه خوب بازی کرد. از آن بازی، فقط کاسیاس در رئال‌مادرید باقی مانده است. از دیگر حاضران کارانکا بود که حالا کمک‌مربی است و بعد‌ها افشا کرد به علت زدن پوستیگا و ریکاردو کاروالیویی که اکنون در رئال است، باید اخراج می‌شده است. این نقطه آغاز مرد پرتغالی در سطح اول فوتبال اروپا بود. از آن به بعد رکوردش شامل 89 بازی تاکنون بوده که نشان از حکومتش بر فوتبال اروپا دارد، آماری که بیش از عالی بوده است: 48 برد (53درصد)، 23 تساوی (27درصد) و فقط 18 باخت (20درصد) و 2 قهرمانی کسب کرده است. تیم‌هایش 140 گل زده‌اند (57/1 گل در هر بازی) و 71 گل خورده‌اند. از این 18 شکست، 9تا برابر اسپانیایی‌ها بوده که بارسلونا با 5 و رئال‌مادرید با 3 پیروزی بهترین رکورد را دارند. لیورپول و وردربرمن هم 2بار تیم‌هایش را شکست داده‌اند. در واقع تیم کاتالانی در چلسی، اینتر و رئال‌مادرید رودررویش قرار گرفته است.
مورینیو همیشه در حال داد و ستد بوده است. پس از بردن مسابقات اروپایی تیم‌هایش را ترک می‌کند. کاری که در پورتو و اینتر آن را انجام داد و وداعش با چلسی هم پس از تساوی ناامیدکننده برابر روسنبرگ بود.
10 لحظه بزرگ مورینیو در ليگ قهرمانان
دپورتیوو 04-2003، نخستین کار بزرگش
نخستین کار بزرگش در ليگ قهرمانان را با پورتو انجام داد که منچستریونایتد و لیون را حذف کرد تا در نیمه‌نهایی برابر دپورتیوولاکرونیا قرار گیرد. پس از تساوی صفر بر صفر در بازی رفت، مورینیو پیش از بازی برگشت در کنفرانس مطبوعاتی به کنایه گفت: «فکر می‌کنم کمی ورم کرده باشند.[مغرور شده باشند]». اما پورتو با جدیت و پرس خاص خود آن بازی را برد. دارلی با پنالتی خود باعث صعود تیم پرتغالی شد و مورینیو با حس انتقام‌جویی گفت: «شایستگی‌های خود را به عنوان یک مربی نشان دادم».
موناکو، 04-2003، پادشاهی در گلزن‌کرشن
گلزن‌کرشن میزبان فینال بین موناکو و پورتو بود. تیم پرتغالی پس از 17 سال به فینال بازمی‌گشت. دشام، مربی تیم حریف نمایندگانش را برای دیدن تیم پورتو فرستاد که او در این راه از مک کارتی و کارلوس آلبرتو استفاده کرد که این قضیه با سورپرایز‌هايي در آلمان همراه بود. وقتی آلنتیشف گل سوم را زد، مورينيو به سوي بازیکنانش فریاد زد: «حالا قهرمانیم». او با اردوی تیمش به پورتو بازنگشت تا راهی چلسی شود.
پورتو، 05-2004، بازگشت با خطر مرگ
قرعه فصل 07-2005 به شکلی بود که چلسی و پورتو هم‌گروه شدند. نخستین بازی‌اش در استمفوردبریج نمی‌توانست از این بدتر باشد. هواداران تیم حریف بشدت هویش کردند اما بدتر از این هم بود. در روز قبل از بازی با پورتو تهدید به مرگ شد و مورینیو تصمیم گرفت در راه بازگشت از پورتو، توسط بادیگارد‌هایش اسکورت شود. او در کنفرانس مطبوعاتی هم شرکت نکرد. پورتو نخستین شکست آبی‌ها را به آنها تحمیل کرد.
بارسلونا 05-2004، فریسک، قربانی نبردش با بارسا
در مرحله یک‌هشتم به بارسا خورد که جنگ با یوفا را آغاز کرد. پس از شکست
2 بر یک برابر بارسا، داور بازی (فریسک) را به گفت‌وگو با رایکارد، سرمربی بارسلونا در رختکن متهم کرد. فریسک تایید کرد با مربی بارسا خوش و بش کرده تا سپس تهدید شود و تصمیم به ترک داوری بگیرد! یوفا، 2 جلسه مورینیو را محروم کرد. ولکر راث، رئیس کمیته داوران او را «دشمن فوتبال» خواند.
بایرن 05-2004، مورینیو براي روی فاریا پیغام فرستاد؟
در ديدار مرحله یک‌چهارم نهایی با بایرن، مورینیو محروم بود. گفته می‌شد در استمفوردبریج نبوده اما برخی می‌گفتند او را در استادیوم دیده‌اند. یوفا به او اجازه فرستادن پیغام به اعضای تیم را نمی‌داد. گفته می‌شد روی فاریا به طور یواشکی از او دستورات را می‌گرفته است. این اتفاق در مونیخ هم افتاد که روی فاریا در کنفرانس مطبوعاتی حاضر شد.
لیورپول 05-2004، گل بود یا نبود ؟
چلسی به نیمه‌نهایی برابر لیورپول رافا بنیتس رسید. بازی رفت با تساوی صفر بر صفر تمام شد. در دور برگشت اما هیجان بالا بود. کار برای سرخ‌ها خوب آغاز شد. در صحنه‌ای جنجالی و مشکوک، لوئیز گارسیا در دقیقه 4 باعث شد تنها گل بازی به ثمر برساند. معلوم نبود توپ از خط رده شده یا نه اما کمک‌داور آن را گل اعلام کرد. بعد‌ها یک کمپانی اسرائیلی اعلام کرد آن توپ گل نبوده که کاملا مشخص بود.
بارسلونا 06-2005، دل اورنو و تئاتر مسی
یک سال بعد، چلسی و بارسلونا باز هم رو در روی هم قرار گرفتند. این‌بار بارسا صعود کرد. در دور رفت، روی تئاتری که مسی بازی کرد، دل اورنو اخراج شد. مورینیو در کنفرانس مطبوعاتی گفت: «کاتالونیا یک منطقه فرهنگی است و تئاتر هم از توانایی‌هایشان است. مسی، بازیگر قهاری است».
بارسلونا 10-2009، آبپاش‌ها در نوکمپ
به عنوان مربی اینتر در نیمه‌نهایی 2010 باز هم با بارسا مواجه شد. در دور گروهی هم به هم خورده بودند اما در سومین بازی‌شان، اینتر 3 بر یک برنده شد. پس از بازی با ژاوی صحبت کرد «با داور صحبت می‌کردم و گفتم شاید یاد بازی چلسی- بارسلونا افتاده باشد.» (به یاد داوری جنجالی اوربو در سال 2009) آن بازی را نرآتزوری‌ها با جشن رسیدن به فینال در نوکمپ به پایان رساندند تا والدس عصبی شود و آبپاش‌ها باز شوند.
آژاکس- میلان، 2010-2011، دور گروهی جنجالی
مورینیو در فصل اولش در رئال‌مادرید هم عملکرد فوق‌العاده‌ای داشت اما نکات تیره‌ای هم به جای گذاشت. 2تا از مهم‌ترین لحظات در دور گروهی بود. در آمستردام به 2 بازیکنانش، راموس و چابی توصیه کرد عمدا کارت قرمز بگیرند. برابر میلان هم با نشان دادن 3 انگشتش به نشانه 3 جامی که با اینتر برده بود وارد زمین شد تا برای هواداران میلان کری بخواند.
بارسلونا 2011-2010، خشم در کنفرانس مطبوعاتی
دوئل جدید اين مربی و بارسلونا. در این باره گوآردیولا به مورینیو در کنفرانس مطبوعاتی گفت: «ژوزه، یک رئیس لعنتی است». بازی رفت در برنابئو با باخت همراه بود که اخراج په‌په توسط اشتارک روی حرکت آلوس در این نتیجه نقش زیادی داشت. جایی که معلوم بود مدافع وسط او را نزده است. پس از بازی مورينیو گفت: «گوآردیولا ليگ قهرمانانی را برده که من شرمم می‌آید آن را ببرم چرا که او با اقتضاح استمفوردبریج به آن رسیده است. امیدوارم روزی بدون چنین فجایعی قهرمان شود».